Penggunaan sistem JomPAY dapat mempercepatkan pembayaran daripada pembekal dan memudahkan kutipan bayaran. Disamping itu, dengan pengesahan pembayaran secara atas talian dapat mengurangkan kesalahan maklumat sesuatu pembayaran tersebut. Penyelarasan laporan juga lebih mudah kerana semua transaksi JomPAY akan digabungkan di dalam satu laporan sahaja.

Disamping itu, sistem pembayaran melalui JomPAY ini dapat membantu mempercepatkan proses pembayaran dari pembekal dan memudahkan laporan transaksi pembayaran direkodkan.